Без фото сложно понять, имел он в виду сам номер, или его расположение.
Номер царапанный? Замятия есть? Окантовка видна, или скрыта рамкой крепежа? Голограмма на лицевой стороне видна?
В любом случае, если номер однозначно читаемый, то основанием для отказа не является.
Цитата
указал в примечаниях что гос номер ТС не соответствует ГОСТ
Цитата
указал что сведения представленные заявителем соответствуют действительности
Противоречий не вижу, одно не является следствием другого.
ГОСТ на номера и их установку.